IBM Superračunalo identificira 77 spojeva koji se mogu boriti protiv koronavirusa

Superračunalo Summit pojavilo se na mreži prije nekoliko godina s više računalne snage od bilo kojeg drugog neraspoređenog sustava. Američko Ministarstvo energetike najavljena ranije ovog mjeseca da će okrenuti veliku računalnu snagu sustava prema pandemiji COVID-19. Stroj je drobio brojeve, kao i sada identificirao 77 kemijskih spojeva to bi moglo pomoći u zaustavljanju koronavirusa.

Summit je najmoćnije superračunalo na Zemlji s velikom razlikom, a ujedno je i treće energetski najučinkovitije. Koristi 10MW snage kako bi zadržao 9.216 POWER9 22-jezgrenih CPU-a i 27.648 Nvidia Tesla V100 GPU-a. Ima teoretske vrhunske performanse od preko 200 petaflopsa i pokazao je 148,6 petaflopsa u praksi dok je radio u Nacionalnom laboratoriju Oak Ridge.



Cilj ogromne računalne snage Summita je specifični protein na površini čestica virusa. Poput ostalih virusa, SARS-CoV-2 mora zaraziti stanice da bi stvorio svoje kopije, a to čini uz pomoć proteina Spike. Te se molekule na površini virusa povezuju s receptorima enzima za pretvaranje angiotenzina 2 (ACE2) na ljudskim stanicama, omogućujući virusu da ubrizga svoj genom i otme stanični stroj.



Summit je izveo simulacije na više od 8000 spojeva, tražeći molekule koje bi mogle inaktivirati virus. Rani rezultati Summita identificirali su 77 spojeva koji se mogu vezati za protein Spike, sprječavajući njegovo vezivanje za ljudske stanice.

Superračunalo Summit pokriva otprilike onoliko prostora koliko dva košarkaška terena. Zasluge: Carlos Jones / ORNL, CC BY 2.0



Nažalost, Summit ne može sam osmisliti tretman. Sva ta procesorska snaga izvrsna je u simuliranju molekularnih interakcija, ali nije idealna za nijansirani proces kliničke analize. Sve što trenutno znamo je da ovih 77 molekula ima dobre šanse da blokiraju spajanje proteina Spike na stanice. Ne znamo ni jesu li spojevi koje je Summit utvrdio sigurni za upotrebu kod ljudi.

Medicinske vlasti morat će procijeniti spojeve i provesti laboratorijska ispitivanja, što na kraju može dovesti do kliničkih ispitivanja s ljudima. Ovo je samo dio naših napora da usporimo širenje COVID-19. Rad na cjepivu je odvojen od ovoga. Cjepivo bi uopće moglo zaustaviti infekcije, ali liječenje temeljeno na radu Summita moglo bi pomoći ublažiti simptome COVID-19 i povećati stopu preživljavanja. Nažalost, cjepiva je puno teže razviti.

Copyright © Sva Prava Pridržana | 2007es.com